（一）氧化錳礦石
以風化礦床的次生氧化錳礦石為主，還有某些沉積型和熱液型礦床的原生和次生氧化錳礦石。礦石中錳礦物主要是硬錳礦、軟錳礦和水錳礦等；脈石主要是硅酸鹽礦物，也有碳酸鹽礦物；常伴生鐵、磷和鎳、鈷等成分。
氧化錳礦石的選礦方法以重選為主。風化型氧化錳礦石常含大量礦泥和粉礦，生產上采用洗礦-重選方法。原礦經洗礦除去礦泥，所得的凈礦，有的可以作為成品礦石，有的需要用跳汰和搖床等再選。洗礦溢流有時也需要用重選或強磁選等方法進一步回收。有的沉積型原生氧化錳礦石，由于開采貧化，生產上采用了重介質和跳汰重選剔除脈石，得到塊狀精礦。
含鐵氧化錳礦石中，鐵礦物主要是褐鐵礦。鐵與錳難以用重選、浮選或強磁選分離，需要采用還原焙燒磁選方法。工業上已采用了洗礦-還原焙燒磁選-重選流程。
（二）碳酸錳礦石
沉積型碳酸錳礦石中，主要錳礦物是菱錳礦、鈣菱錳礦、含錳方解石和菱錳鐵礦等；脈石有硅酸鹽和碳酸鹽礦物；也常伴生硫和鐵等雜質。礦石一般比較復雜，錳礦物嵌布粒度細到微米，不易解離，往往難于得到較高的精礦品位。
碳酸錳礦石選礦生產實踐較少，研究了強磁選、重介質選礦和浮選等方法。有的沉積型含硫碳酸錳礦石，工業上采用了炭質頁巖、黃鐵礦和錳礦物的順序優先浮選流程。有的熱液型含鉛鋅碳酸錳礦石，采用了浮選-強磁選流程。某些含硫富錳礦石，錳礦物主要是硫錳礦，可以采用焙燒方法除硫。有的富碳酸錳礦石生產上也采用焙燒方法，除去揮發成分，得到成品礦石。
氧化錳和碳酸錳礦石中都含有一些難選礦石，錳與鐵、磷或脈石緊密共生，嵌布粒度極細，難以分選，可以考慮用冶煉方法處理。例如，處理高磷高鐵錳礦石的富錳渣法，生產活性二氧化錳的硝酸浸出法和生產金屬錳的電解法等均已有工業生產。此外，還在研究連二硫酸鈣法和細菌浸出法等。